三九胃泰可以治療慢性萎縮性胃炎，其具有清熱燥濕、消炎止痛、行氣和胃、活血化瘀、滋陰清熱作用，因此對于疾病導致的濕熱阻滯、氣血阻滯、陰虛內熱、氣滯血瘀等具有一定治療作用。慢性萎縮性胃炎從中醫角而言，具有脾氣虛弱、氣血不足、脾胃虛寒、胃陰不足等證候表現，三九胃泰具有相應功效。因此，對于萎縮性胃炎所出現的胃脹、胃痛、反酸、燒心、嘈雜、不適、食欲不佳、納差、早飽、噯氣、呃逆等癥狀，此藥具有一定治療作用。