伽瑪刀治療腦瘤具有一定的優勢，患者不需要開顱，基本上沒有創傷，但是伽瑪刀治療腦瘤也有一定的副作用，包括它所帶來的放射性損傷。因為在伽瑪刀治療腫瘤的過程中，不可避免地會損傷一部分正常細胞，包括在治療路徑上的頭皮、顱骨、硬膜，以及腫瘤附近的一些腦細胞，都有可能出現放射性壞死。放射性壞死如果不是很嚴重，通過一些保守治療，能夠獲得較好的緩解。如果比較嚴重，還有可能發展到腦疝的程度，必須通過手術的處理。另外，伽瑪刀不是對所有的腦瘤都有效，由于部分腦瘤不是很敏感，因此不適合通過伽瑪刀治療。此外，伽瑪刀也不適用于直徑超過3cm的腦瘤。如果腦瘤包裹了一些重要的腦神經，若通過伽瑪刀治療損傷到腦神經，后果也比較嚴重。所以在選擇伽瑪刀治療腦瘤時，一定要嚴密地把握適應癥。