早上起來出現肚子疼，考慮可能有以下幾種疾病：1、胃相關疾病：最常見的是十二指腸潰瘍，十二指腸潰瘍的特點就是空腹時疼痛，晨起患者會出現胃痛，往往在吃過飯或者吃抑酸藥，中和胃酸的藥物之后，癥狀得到緩解。除此之外，有些患者胃酸分泌過多，僅是慢性胃炎，也有可能會出現早上起來肚子疼；2、腸道功能性疾病：有些患者有腸道功能紊亂，比如腸易激綜合征，患者在晨起會出現臍周絞痛，隨后出現大便習慣和大便性狀的改變，可以出現腹瀉、大便次數增多等，此時可以應用益生菌以及調節胃腸道動力的藥物，進行綜合治療；3、胃腸道器質性病變：比如有胃腸道腫瘤，或者炎癥性腸病，有可能會引起腸道梗阻，比如完全腸梗阻以及不完全腸梗阻，患者在早晨起來，有可能就會出現腹痛，同時伴有排便、排氣不暢。