治療灰指甲可以口服抗真菌的藥物，灰指甲是甲真菌感染指甲導致，因此主要選用抗真菌類治療，口服藥比較常用的有伊曲康唑、灰黃霉素等，都可以抑制真菌。伊曲康唑和灰黃霉素類抗真菌藥物，通常都是經肝代謝，因此在服藥前最好是去醫院檢查，服用期間也要定期監測肝功能，避免藥物傷肝的情況發生。還要注意藥物相互作用，像伊曲康唑與很多藥物之間存在藥物相互作用，如果還患有其他慢性病，如高血壓，需要去找醫生咨詢藥物之間是否存在沖突，如治療高血壓的CCB類藥物與伊曲康唑之間有相互作用，會增加CCB類藥物的不良事件的發生率，所以不能同時服藥。