先天性心臟病的篩查可以通過視、觸、叩、聽，即基本臨床體格檢查方法，視診觀察孩子面色、孩子發育情況、精神情況；觸診是觸摸心前區心尖波動的范圍強弱；叩診可以看心臟濁音界大小，明確孩子心臟大小；聽診即可以通過心臟聽診發現心臟雜音或心臟強弱，有無心律失常。 此外，也可以做經皮氧飽和度，這是很重要的直接無創性檢查方法，是先天性心臟病的篩查方法。