先天性上瞼下垂有一定的遺傳比例。在臨床過程中經常看到爺爺輩、父親輩，甚至幾代都出現這種情況，同時伴有小眼畸形。眼睛小又睜不開，兩個眼睛距離較遠，這種是小眼畸形。小眼畸形的發生率較高，有遺傳因素。 現在發現其有相關的基因位點，患者父親、爺爺輩有這種基因，下一代都會遺傳該基因，產生上瞼下垂。所以，先天性上瞼下垂有一定的遺傳因素。如果發現有兩代遺傳因素，可以做基因檢測，目前基因檢測水平位點的檢查較準確。所以先天性上瞼下垂，尤其是小眼畸形這種發展的遺傳幾率較高。經常在臨床中，母親、父親是這樣，兒子、女兒也是這種情況。小眼睛、上瞼下垂，還要注意觀察。 先天性上瞼下垂也有由于產傷導致，在母體內提上瞼肌的肌肉受到損傷，會出現上瞼下垂，這是單側輕度的，不會遺傳。