龜頭上有小水皰，常見于以下原因：1、皰疹病毒感染：病人發生龜頭生殖器皰疹病毒感染時，會出現龜頭表面起小水皰癥狀，水皰破裂后會局部形成糜爛面，會形成疼痛和瘙癢癥狀；2、真菌感染：病人發生白色念珠菌性龜頭炎時會出現龜頭紅疹、紅斑，還會出現水皰、膿皰。水皰、膿皰破裂后，會形成糜爛面，還會形成脫皮、脫屑癥狀；3、滴蟲感染：病人發生滴蟲性龜頭炎時會出現局部紅疹、紅斑，紅斑上會形成增加樣數個小水皰癥狀，破裂后會形成糜爛面，導致局部瘙癢癥狀。病人出現上述癥狀時，需及時到皮膚性病科或泌尿外科就醫，通過局部分泌物檢查，通常能找到致病微生物。通過選擇有效的藥物對癥治療，多數病人龜頭上有小水皰癥狀會徹底好轉。