龜頭起水泡的最主要原因是生殖器皰疹，生殖器皰疹是皰疹病毒2型引起的疾病，疾病感染到生殖器后會導致生殖器皰疹。生殖器皰疹的特點，如在龜頭、包皮、陰莖體上或者在女性外陰，起水皰，水皰往往多發且表現為水狀，水皰起來后過幾天會破潰，水皰之間會融合，這時患者會表現燒灼、疼痛感。 通常生殖性皰疹可能會反復發作，每次發作時間持續約在1周，1周可能會完全自愈，如果身體抵抗力下降或者情緒不佳時還會再復發。如果化驗經過醫生診斷，確實診斷為生殖期皰疹，應該用藥治療，目前主要是使用抗病毒藥物治療。