腹腔鏡膽總管囊腫手術，過程主要是包括膽總管囊腫的完整切除、膽管和小腸重新吻合。如果手術比較熟練，2-3個小時就可以完成，但是手術時間也取決于手術難度以及局部是否出現炎癥粘連、繼發膽管結石、血管的變異等。對于囊腫比較大，反復出現炎癥、局部解剖結構不夠清楚，微創手術時間勢必會相應的延長。手術時間的長短并不是衡量手術成功以及醫生技術水平的唯一標準。對于成功的微創手術，不僅要靠熟練的手術技術，還要取決于手術的器械以及病人的體型。如果病人比較肥胖，手術的難度勢必明顯增大。另外膽總管囊腫還需要根據具體的分型、囊腫的大小以及局部解剖的結構，這樣綜合的因素才能夠影響手術的成功率。