懷孕40天B超看不到孕囊為不正常的情況，懷孕40天通常可以看到孕囊。孕囊出現的時間為孕5周，5*7=35天，停經5周即懷孕5周，孕35天后即可看到孕囊。懷孕40天不但會出現妊娠囊，亦能看到胎芽，通常孕42天，即孕6周出現胎芽甚至可以看到早期的胎心管搏動，具體與機器的靈敏度和超聲醫生的經驗有關。如果懷孕40天在B超下未看到妊娠囊，可能為停育或排卵較晚，即懷孕天數未達到40天，實際懷孕天數可能為30天。部分女性的月經周期為40天，此時停經40天不等于懷孕40天。懷孕40天指月經周期正常的女性停經40天，此時則約等于懷孕40天，B超下應該可以看到妊娠囊。但部分女性會出現排卵異常，比如排卵靠后而未出現妊娠囊，有這種可能性。一旦懷孕40天而未看到孕囊，需要檢測HCG和孕酮的水平綜合考量。