引起牙齦炎最常見的病因是菌斑和微生物，牙垢、牙石、食物嵌塞等，不良習慣和嗜好，化學物質刺激、錯(牙合)畸形、不良修復體、放射線損害、牙菌斑成分的代謝物都能直接對牙齦組織發生破壞作用。 牙周致病菌會附著在牙齒周圍，如果形成牙結石或軟垢，對牙齦會產生刺激作用。在細菌刺激牙齦1-2天內，牙齦會有輕度炎癥反應，表現為齦溝液增多。一周后牙齦出現臨床癥狀，牙齦紅腫，探診后出血。如果刷牙可以出血，一般在20天左右牙齦炎可進入確立期。牙齦炎初步形成時，可通過潔牙徹底治療。 某些全身因素也可引起牙齦炎，這些原因并不是引起牙齦炎的直接因素，而是它們可能會導致牙齦菌斑的生物反應性增高，如激素水平改變，孕婦、青少年可出現牙齦炎，長期服用某些藥物可引起牙齦增生，如硝苯地平等抗高血壓藥物。