男性肚子右側疼痛的原因比較多，右側疼痛分為右上腹疼痛和右下腹疼痛，疼痛的部位不一樣，原因也會有所不同，具體如下：1、右上腹疼痛：首先要考慮肝臟和膽道系統疾病，比如肝臟腫瘤，出現肝癌、肝內膽管結石、肝膿腫等，這些可能會引起疼痛。還有膽總管和膽囊如果有結石、炎癥、腫瘤時，也會引起這種疼痛。對于肝膽疾病，可以做彩超檢查明確診斷，準確率比較高。右上方還有一些病變，當結腸肝區、胃竇和十二指腸等部分出現疾病，比如患有胃竇潰瘍、十二指腸潰瘍、十二指腸腫瘤等，也會引起右上腹疼痛。此時一般需要進行胃十二指腸鏡的檢測。對于橫結腸右半部以及升結腸脾區的病變，一般需要做結腸鏡，查看是否有腫瘤、炎癥；2、右下腹疼痛：首先考慮闌尾區病變、回盲部病變，如果有闌尾炎、闌尾腫瘤、回盲部腫瘤，就會出現右側疼痛，此時一般通過結腸鏡檢查，還有CT的檢查就可以明確診斷。其次，右上腹還有回腸末段的小腸，這些回腸末端小腸好發腸結核、克羅恩病，這些疾病也會引起疼痛，這種一般需要通過消化道造影，或者CT進行檢查。此外，右下腹還有右側輸尿管結石，都可能會造成右側腹部疼痛。右側腹部疼痛的原因比較多，要根據不同的部位、不同的疼痛性質做相應的檢查。