卵巢囊腫和子宮肌瘤通常屬于良性病變，臨床無法比較兩者的嚴重程度。疾病的嚴重性主要根據性質決定，比如惡性腫瘤，相比良性腫瘤明顯更為嚴重，且預后可能更差。大部分卵巢囊腫和子宮肌瘤屬于良性病變，但特殊情況下可能發生惡變，卵巢囊腫發展為卵巢癌，子宮肌瘤發展為子宮肉瘤，兩者預后均較差。單純從卵巢囊腫、子宮肌瘤而言，無法比較兩者嚴重性。良性腫瘤也并非沒有危害，卵巢囊腫生長比較迅速時，會對周邊組織、臟器造成壓迫，甚至發生自發性扭轉、破裂。此時會進一步造成急腹癥，需要進行急診手術，嚴重時也有可能會引起卵巢壞死，需要切除一側附件。絕大多數子宮肌瘤屬于良性腫瘤，當子宮肌瘤生長速度較快，便會出現可疑惡變，或者黏膜下等特殊位置的子宮肌瘤可能會引起腹痛、月經量增多、淋漓不盡的陰道出血，甚至出現失血性貧血、失血性休克。因此，分析卵巢囊腫、子宮肌瘤的嚴重程度時因人而異，需具體情況具體分析。