復雜性熱性驚厥相對于單純性熱性驚厥而言，發病率較低，大約是30%左右，且發病年齡范圍較廣，不僅僅是6個月到5歲的嬰幼兒，此外對于年齡小于6個月，或者大于5歲的患兒也有可能出現熱性驚厥。 此外，復雜性熱性驚厥發作不僅因高熱導致，甚至低熱也可以誘發，且發作形式可以是全身性抽搐，也可能是局部抽搐，發作持續時間通常超過10分鐘，甚至部分患兒持續狀態超過30分鐘。復雜性熱性驚厥在一次病程當中反復發作，甚至超過2次，在發作之后往往會留有一定神經系統異常體征，做腦電圖檢查也會發現有異常波。復雜性熱性驚厥也是后期轉變成癲癇的高危因素，在臨床上發病相對較少，但是可以通過腦電圖來評估。