三叉神經疼痛部位主要在頭面部，三叉神經主要包括眼支、上頜支以及下頜支三個分支。當眼支出現病變時，疼痛部位主要在額部與眼部周圍。當上頜支出現病變時，主要出現在鼻翼上層全部以及上牙槽神經，包括門牙、門齒附近側牙。當下頜支出現病變時，下牙槽、頰部甚至舌部都會出現劇烈疼痛。 因部分咀嚼功能也通過三叉神經來支配，因此三叉神經引起的疼痛，從支配區域可看出主要在面部、頰部。三叉神經疼痛位置較明確，為面部，包括口角、唇角、眼角等部位。此外，下頜角受到刺激后，也可引起劇烈疼痛，方可診斷三叉神經痛。