很多人腎疼和腎區的疼痛區分不開，所以要仔細的分析腎區的位置以及腎區的組織和器官出現了病變，才能進行詳細的鑒別診斷。腎區不但包括腎臟，還包括皮膚、肌肉、骨骼和輸尿管等，因為每天早晨都腎疼，皮膚局部的病變可能性不大。每天早上腎疼有可能是肌肉骨骼的病變，或者腎臟本身的病變。肌肉的病變最常見，持續存在很長時間的疼痛不適的情況就是腰肌勞損。腰肌勞損是肌肉受到損傷而表現出來的一種異常，在夜間睡覺的時候床鋪過硬過軟，容易出現加重，所以早晨起來容易出現腰部不適或者疼痛的感覺。腰椎間盤突出和骨質增生可以長期的存在，在夜間睡覺的姿勢不合適，或者床鋪過硬、過軟的時候，容易出現加重、出現疼痛。腎臟疾病如果長時間的存在，例如結石、積水的情況，可以存在早晨起來腎臟的不適。因為不同的病因處理的方式不同，所以對于每天早晨起來發現腎區的疼痛，需要仔細的進行鑒別診斷。