結扎手術屬于比較小的手術，在腔鏡下進行，通常沒有副作用，但如果在結扎手術當中出現并發癥，比如出現出血或感染，可能會引起副作用，比如感染后治療不徹底，可能出現慢性的盆腔炎癥，會引起來盆腔的慢性疼痛。另外，輸卵管結扎后，輸卵管一側通，內側通向宮腔，外側結扎，如果通向宮腔的輸卵管因為炎癥或其他原因，比如輸卵管扭曲，造成梗阻，此時輸卵管內分泌液體流不出來，會積在輸卵管內形成盆腔包塊，也會引起疼痛。在輸卵管結扎手術出現并發癥后，出現的副作用，如果手術進行的很順利，沒有相關的并發癥，通常輸卵管的結扎沒有副作用，而且結扎后若患者想懷孕，還可以做輸卵管再通術，也能夠保證受孕，不會有太大影響。