通常頭顱CT與顱腦磁共振區別主要如下：1、成像原理：頭顱CT主要反應組織密度，包括高密度與低密度病灶。而頭部核磁依據不同序列，可進行不同組織檢查，比如T1加權像，主要觀察腦部結構、解剖，T2加權像主要觀察病灶，而DWI可以區分新發病灶、血管成像與磁敏感成像；2、掃描時間：頭顱CT只有一個成像序列，檢查時間較快，3分鐘左右可以完成掃描。而對于頭顱磁共振，普通頭顱磁共振平掃大致序列有5個，進行掃描時間較長，如果再加血管成像序列，大致需要20-30分鐘；3、禁忌癥：頭CT檢查存在輻射，對于懷孕、備孕患者不建議使用。而對于顱腦核磁而言，有幽閉恐懼癥或體內存在金屬患者，無法進行核磁檢查；4、病變敏感程度：頭顱CT與顱腦磁共振，對于不同病變敏感程度有所不同。