藿香可以治療口臭，口臭產生機制為清氣不升、濁氣不降，濁氣不能夠從下面排走而上逆時，即可通過口腔產生讓人不愉快的氣味，俗稱口臭。治療濁氣不降的藥物，一般有一定治療口臭作用。藿香具有芳香化濕以及解暑、止嘔作用，主要用于濕阻中焦、中氣不運，即濕氣停留中焦導致氣機不暢，可出現肚子脹滿、食欲不振，甚至導致惡心、嘔吐的情況。此時通常伴隨舌苔白膩、身體困乏等濕邪阻滯癥狀，可用藿香通過化濕理氣作用，有效解決濕阻導致氣機升降失調，通過這種方式達到治療口臭的目的，臨床上通常與佩蘭相配合使用。佩蘭也是治療口臭的藥物，古人所謂吐氣如蘭，通常指佩蘭，通過藿香與佩蘭的配合治療，可去除濕阻中焦的口臭。