發燒的原因，多數是由于細菌或者病毒感染，導致細菌、病毒，進入體液內、血液內，其中少量充斥到腦內，會引起無菌性腦膜炎，導致頭疼。同時由于發燒，出現血液流速和心率增快，還會使血壓升高，出現更多的血液，涌到大腦內，引起腦部脹、痛的感覺。少量細菌會進入肺部，或者感染部位的同時，進入腦細胞，或者腦膜，引起繼發性的，或少量比較輕微的感染，這種情況是發燒后頭腦脹、痛不適的主要的原因，是人體自我保護、自我修復的常見機制，患者無需驚慌。