牙拔除后，骨組織和軟組織受到不同程度的損傷，創傷造成的代謝分解物和組織應激反應產生的激活物，刺激神經末梢引起疼痛。除創傷外，過大的拔牙創傷，凝血塊的脫落分解，使牙槽骨壁上的神經末梢暴露，受到外界的刺激，也可能會引起疼痛，通常像阻生齒拔除后常會出現疼痛，因此術后需常規鎮痛治療。 這種疼痛術后當日即可出現，拔牙創口多正常，即使拔牙創口空虛，無腐敗壞死的組織，疼痛不嚴重，3-5天內會逐漸消失。如拔除智齒后2-3天以后，還有劇烈的疼痛，或疼痛又加重了，并且向頭頂部、下頜下區放射，止疼藥不能止疼，拔牙窩內空虛或者是有腐敗變性的血凝塊，有異味，異味強烈，則需要及時就醫，通常及時處理以后10天左右疼痛會逐漸消失。因此，醫生會盡量減少手術的創傷，保護拔牙創口內的血凝塊，而且患者一定要尊重醫囑，如拔牙當天不要漱口。