食管間質瘤在醫學上是惡性腫瘤，不能稱為癌。因為癌是醫學名詞，醫學名詞與日常所說的癌存在一定的區別，平常所指的癌是惡性腫瘤，惡性腫瘤是比癌更廣泛的詞語，癌只是其中一部分。來源于上皮組織的惡性腫瘤叫癌，來源于非上皮組織，如間葉組織的腫瘤通常稱為肉瘤或者瘤。而食道間質瘤是來源于食道平滑肌，并不是上皮組織，因此稱為食道間質瘤或者食道平滑肌瘤或肉瘤，并不稱為癌，也是指口語上的癌癥或惡性腫瘤。醫學上把所有的食道平滑肌瘤、食道間質瘤都稱作食道間質瘤，其為惡性腫瘤，但不是醫學上的癌，可能是日常所指的癌癥，即惡性腫瘤的意思。