神經內鏡在神經外科的應用包括三點：1、腦室鏡外科；2、經鼻內鏡顱底外科；3、經顱內鏡鎖孔手術。鼻內鏡手術主要用于后兩種手術，而狹義的神經內鏡主要指腦室內鏡外科所使用的神經內鏡。這種神經內鏡主要是在內鏡中有單獨的通道，可以進行手術，也叫鏡內手術。而后兩種手術把鼻內鏡當成觀察鏡，經過鼻腔、蝶竇等副鼻竇來進行鞍底和顱底手術。實際上鼻內鏡包含神經內鏡的范疇之內。鼻內鏡和神經內鏡兩者相依托而生，相輔相成，有很多的器械很類似，但由于手術目的和到達范圍不同，所需器械和關注點也不一樣。神經外科主要關注腦和脊髓，所以儀器更加精密。