陰莖癌發生的原因認為與癌基因異常激活、抑癌基因失活導致機體平衡被打破有關，具體原因如下：1、包莖：包莖患者容易導致包皮垢長期堆積于冠狀溝局部，無法及時清理。長時間以后，包皮垢中分泌代謝的毒性產物會對龜頭黏膜、冠狀溝黏膜、陰莖內板的黏膜細胞，產生強大的致癌效應。因此包莖以及包皮垢的長期刺激，是臨床公認的導致癌基因激活、抑癌基因失活的重要推手；2、家族遺傳：如果家庭內有陰莖癌患者，其一級親屬的發病率會比普通人群高；3、飲食：高鹽、高脂飲食也可能會加重包括陰莖癌在內的多種惡性腫瘤的發病風險；4、環境因素：大氣污染、尾氣排放等，也會導致陰莖癌的發生風險增加；5、特殊行業人員：長期接觸或經呼吸道接觸化學產物，有可能會增加陰莖癌的發生風險。