陰莖癌最重要的治療原則就是早發現、早治療。從治療方法而言，發現越早，采用治療方法也就越微創，比如Ⅰ期陰莖癌，可以用激光方法切除病灶，也可以進行局部放療。 而隨腫瘤越長越大，則不得不采用陰莖部分切除，并且隨疾病進一步進展，可能還需要應用腹腔鏡進行腹股溝和盆腔淋巴結的清掃。如果疾病惡性度很高，懷疑有遠處轉移的可能，還需要配合化療。另外，可以采用生物靶向藥物治療，并且需要進行陰莖重建，以恢復患者站立排尿和勃起功能等。