聲帶囊腫的手術幾乎沒有痛苦，手術是在全身麻醉下進行，主要在支撐喉鏡下使用顯微鏡，同時使用纖維器械或激光進行囊腫切除。聲帶囊腫切除過程中，主要將聲帶囊腫完整剝離以后，將囊壁徹底切除，從而防止再次發作。通常可以使用顯微剪刀切除聲帶囊腫，也可以使用激光切除囊腫，特別是二氧化碳激光。聲帶囊腫手術以后，通常需要進行霧化吸入治療，同時需要休聲，即3-7天盡量少說話，使聲帶得以休息，可以使傷口盡快愈合。1周之內禁食辛辣、刺激食物，同時需要禁煙、禁酒，促使聲帶較快恢復正常狀態。通常1個月左右，即可達到正常發聲。