3歲寶寶反復咳嗽，除止咳、化痰的對癥處理外，更重要的是明確反復咳嗽原因，對因治療，具體如下：1、耐藥細菌感染：如果普通抗感染治療無效，咳嗽有痰，特別是膿痰，可以進行痰培養檢測。如果考慮耐藥菌感染，可以根據藥敏選用敏感抗生素，進行足療程抗細菌感染治療；2、支原體、衣原體感染：可以進行支原體、衣原體檢測，選用大環內酯類藥物治療；3、真菌感染：進行真菌培養如真菌G試驗、GM試驗等，選用敏感的抗真菌藥物治療；4、非感染原因：3歲寶寶出現干咳為主，特別是晨起干咳，或者夜間凌晨干咳，或者活動后干咳，要考慮咳嗽變異性哮喘或者過敏性咳嗽，可給予相應抗哮喘、抗過敏治療。