顱內的真菌感染分幾個大類，常見的是新型隱球菌感染，其他相對比較少見，包括毛霉菌、曲霉菌病。正常情況下，大腦有血-腦屏障，這些病原微生物很難感染大腦，尤其真菌感染更為少見。但免疫力低下的人群比如艾滋病、器官移植服用免疫抑制劑的患者，接受免疫抑制劑的治療以及有免疫相關的疾病長期服用激素，抵抗力不好，容易繼發二重感染。另外由于長期的抵抗力下降以及惡病質狀態、系統性疾病太重，這時也會引起真菌的感染。特殊人群職業也容易暴露在真菌環境當中，比如養鴿子病，由于隱球菌容易在孵蛋的土壤中存活，所以在養殖鳥類的人群當中，因大量接觸鴿子的糞便、排泄物以及土壤，所以是易感的人群。