大多數病毒性腸炎可以通過對癥治療自行緩解，不同癥狀對應不同的藥物治療，具體如下：1、腹瀉：可以選擇止瀉的藥物，如蒙脫石散等；2、腹痛：可以選擇調節腸道動力的藥物緩解腸道痙攣，從而改善癥狀，如曲美布汀等；3、菌群失調：可以補充益生菌調節腸道菌群，如雙歧桿菌三聯活菌、布拉氏酵母菌散、枯草桿菌二聯活菌等；4、脫水：少部分患者可能存在脫水的癥狀，需注意補充口服補液鹽；5、感染：合并細菌感染的患者，在進行對癥治療的同時，需進行抗細菌等抗感染的治療；6、腸道潰瘍：部分病毒性腸炎，如巨細胞病毒性腸炎、EB病毒性腸炎可能會引起腸道的潰瘍，從而引起癥狀持續。此時需要進行抗病毒治療，使用更昔洛韋、膦甲酸鈉類抗病毒藥物。通常療程需2周以上，才可得到明顯改善，注意規律治療后，需定期復查腸鏡了解潰瘍愈合情況。