若女性患有甲亢，在服藥期間懷孕會對胎兒造成影響，所以通常不主張甲亢未控制好時貿然懷孕，而是將甲亢控制后停藥再懷孕。但甲亢屬于慢性病，較多的甲亢患者需要常年服藥，所以對于高齡的女性，也可以在甲亢基本控制后服用小劑量的抗甲亢藥物并懷孕。在妊娠早期，患者應選擇丙硫氧嘧啶進行治療，因為在妊娠早期，丙硫氧嘧啶比甲巰咪唑的安全性更高，導致胎兒出現畸形的幾率更低。所以若甲亢患者想要懷孕，應在甲亢基本控制后將抗甲亢藥物更換為丙硫氧嘧啶。而在懷孕期間，患者需要嚴密監測甲狀腺功能，因為懷孕后由于機體免疫耐受，甲亢可能會逐步緩解，所以抗甲亢的藥物也需進行調整。若通過逐步調藥使甲亢維持在可以妊娠的正常值，則甲亢婦女能夠正常妊娠、分娩。所以甲亢的女性患者懷孕存在風險，但可以在懷孕前與醫生仔細商量，選擇備孕時機，并且在懷孕過程中嚴密監測甲功，使甲功維持在正常范圍內，從而使甲亢對胎兒的影響較小。