垂體瘤手術的并發癥主要有術后鞍內血腫、鼻衄，而鼻衄就是鼻腔的小動脈出血、黏膜潰爛出血或假性動脈瘤破裂出血。此外，還包括腦脊液鼻漏、腦膜炎、垂體功能低下、尿崩癥、水電解質紊亂、眼肌麻痹、鼻中隔穿孔等并發癥。其中垂體功能低下和尿崩癥是由于垂體前葉、后葉及垂體柄損傷導致。如果術中正常，垂體前葉、后葉及垂體柄保護良好，這種并發癥往往呈一過性。如果腫瘤巨大，切除腫瘤過程當中，垂體前葉、后葉及垂體柄損傷嚴重，術后垂體功能低下及尿崩癥可能要持續很長一段時間，需要相應的藥物治療。如果術中或術后處理及時，其他的并發癥大部分都可以恢復。