大多數甲減患者的甲狀腺都在縮小和萎縮，主要是由慢性炎癥導致的甲狀腺細胞的這種逐漸凋亡和死亡，所以甲狀腺逐漸在萎縮。在甲減的早期，或者是橋本氏甲狀腺炎比較活躍的時候，有可能會出現一過性的甲狀腺腫大，脖子會變大。這種情況主要是甲狀腺的慢性炎癥比較活躍，甲狀腺細胞充血比較嚴重，早期的時候甲狀腺細胞沒有死亡過多，升高的TSH，會促進甲狀腺細胞合成、釋放甲狀腺激素增多，整個甲狀腺細胞都非常活躍，這時候會看到頸部有變大的現象。