患者肛門內部隱痛，依據疼痛原因不同，服用的藥物種類也會有所區別，具體如下：1、肛竇感染：如果患者因肛竇的感染造成局部疼痛癥狀，可以通過口服消炎藥減輕局部炎癥，比如阿莫西林、頭孢噻肟、頭孢曲松，可以有效減輕局部感染，使患者局部疼痛癥狀逐漸改善；2、痔瘡：如果患者因局部的痔瘡引起肛周疼痛癥狀，可以適當口服邁之靈、地奧司明片減輕局部痔瘡水腫，從而可以減輕痔瘡疼痛。一般局部用藥效果往往較好，如果口服用藥在體內完全吸收代謝后，到達肛門口局部的藥效較弱。痔瘡患者局部疼痛時，采用龍珠軟膏、馬應龍痔瘡膏(馬應龍麝香痔瘡膏)、云南白藥痔瘡膏局部涂抹，或使用太寧栓(復方角菜酸酯栓)、牛黃痔清栓等，可以較好減輕局部組織水腫，改善疼痛癥狀。肛周疼痛時也可以適當采用溫鹽水或復方黃柏液進行坐浴，以改善血液循環，減輕疼痛癥狀。