通常肺炎不需要做支氣管鏡檢查，但是部分肺炎在特殊情況下，需要做支氣管鏡檢查，比如不能確診的嚴重肺炎、快速進展的肺炎、多種抗生素治療無效的肺炎、醫院內的感染性肺炎、機械通氣過程中進展的肺浸潤灶以及感染不典型，并且合并嚴重免疫受損的患者。 通過支氣管鏡檢查，可了解支氣管鏡下支氣管內的情況，同時在支氣管鏡下可取痰，用于檢查病原學。經支氣管鏡檢查后，可了解這些特殊肺炎的病因，從而更好地指導治療。