如果長期大量用糖皮質激素，其副作用不容忽視，長期大劑量使用可以導致庫欣綜合征，也就是腎上腺皮質功能亢進的綜合征，包括水、鹽、糖、蛋白質以及脂肪的代謝紊亂。另外還有向心性肥胖、滿月臉、水牛背、皮膚痤瘡、多毛以及高血鈉、低血鉀、高血壓、水腫、高血脂、高血糖或使糖尿病的癥狀加重，以及腎上腺皮質功能減退甚至萎縮。女性可以出現閉經等副作用，還可伴有肌肉消瘦、無力，以及骨質疏松、股骨頭壞死等一系列副作用。此外糖皮質激素的副作用還包括可以減弱機體的抵抗力，誘發或加重感染，阻礙組織的修復，延緩組織的愈合，抑制兒童的生長發育。所以兒童在生長期如果應用糖皮質激素，需要注意要密切關注不良反應，盡量避免或降低糖皮質激素對兒童生長和發育的影響。此外大劑量使用糖皮質激素的女性建議不要懷孕，因為可能會引起胎兒畸形等。