因為肛周膿腫靠近肛門口，一般是大腸埃希細菌感染，有80%左右的可能。頭孢類即先鋒霉素類藥物如果不過敏，可以使用頭孢類藥物，僅是經驗性用藥。肛周膿腫病人可以進行膿液做培養，根據藥敏選擇合理的抗生素，是最好的方法。但是在臨床上有缺陷，因為膿液培養一般在3天左右出結果，而切開引流或者到醫院后當場使用藥物，治療速度比較快。經驗性用藥現在一般選用頭孢類藥物比較多，廣譜藥物也可以使用。除此以外，對于肛周膿腫患者一定要早期處理，有的患者已經發現肛周膿腫，認為自己會好而不去治療。其實肛周膿腫一般不會自行好轉，除非自身抵抗力好的情況才會自行好轉，還是要早期發現，早期處理。