淚囊鼻腔吻合術沒有太多副作用，除去麻醉本身有可能產生的副作用之外，手術可能會導致鼻腔干燥，或者是吻合口瘢痕狹窄以后可能又再次不通，發生率很低。大多數患者可無任何不適，極少部分人可能會有麻醉意外，但麻醉意外問題對于所有的手術發生幾率都非常低，所以手術還是非常安全的。 淚囊鼻腔吻合術是通過鼻腔把淚囊靠近鼻腔這一邊的骨頭磨掉，把淚囊打開。在鼻內鏡手術里相對比較簡單，創傷也非常小。因為淚囊本身就不大，在鼻腔這內側壁，面積很小，所以手術只需要磨除大概直徑1cm的骨頭，把淚囊打開就可以。