卵巢功能檢查一般情況下都會進行卵巢的基礎激素水平測定，一方面是需要看卵巢基本上的雌激素水平、孕激素水平以及卵泡刺激素、黃體生成素等功能檢測。通常會安排在月經期的第3-5天，也就是卵泡基本上還沒有完全的生長、發育時。這是一個最基礎的卵巢激素水平測定，可以進行黃體生成素、卵泡刺激素、雌激素、垂體泌乳素和雄激素水平的測定。如果涉及到卵巢的排卵功能，可以進行超聲的檢測來嚴密觀察卵泡生長、發育，直至破裂排卵。一方面可以觀察卵泡生長、發育得好不好，另外也可以除外LUFS綜合征，即卵泡未破裂綜合征。卵泡未破裂綜合征患者依然會有正常的月經，除非通過超聲檢查發現。實際上到該排卵時卵泡沒有破裂，卵子沒有排出。其他激素水平的內分泌檢查完全都是正常狀態，但依然還會發生不孕癥的問題。這是因為卵子無法從卵巢的表面破出，就無法和精子相遇，這是通過超聲檢查來監測卵巢排卵的問題。如果想看卵巢排卵后所形成的黃體功能好不好，就可以在月經前1周的時間。也就是黃體功能最為旺盛時進行孕酮水平的測定，這時孕酮的指標應當是處于黃體期的改變。除了上述這些檢查之外，通過卵泡刺激素、黃體生成素的水平高低能夠初步判斷發生月經不調的基礎性原因。到底是在卵巢，還是在卵巢的更上游，如下丘腦因素、垂體因素等，這也是能夠幫助判斷卵巢出現排卵功能障礙時必不可少的一個檢查項目。另外對于那些懷疑可能患有多囊卵巢綜合征或早發型的卵巢功能不全，甚至卵巢早衰的患者還可以進行抗苗勒氏管激素的測定，即AMH的測定。