顱腦MRI檢查包括很多序列，但是最常用的就是顱腦的磁共振平掃，可以觀察腦實質的解剖形態結構。此外，還有一些成像，如磁敏感成像、彌散成像、腦灌注成像、顱內的動脈成像和靜脈成像，都是臨床工作中常用的一些序列，用于臨床解決疾病和診斷疾病。需要強調一下，磁共振的磁敏感成像是比較有優勢的序列，可以觀察微出血灶，其它檢查達不到。此外，磁共振的灌注成像現在已經應用越來越廣泛，可以早期發現腦內的缺血病灶，對臨床的實用價值也很高。 常規的磁共振平掃除能解決腦出血、腦血管畸形、腦缺血等腦血管病以外，還可以發現腦腫瘤、腦的代謝性疾病。如果在腦內發現病灶，如果磁共振平掃不能解決，還需要增加平掃后的增強掃描，注射釓造影劑，進一步判斷病灶的血供，以及有沒有破壞血-腦屏障及病灶范圍，為臨床提供更多的影像學信息。