隱匿性陰莖手術不光需做陰莖延長，同時需解決包莖，手術一般在1個小時左右，需解決多種問題，如需解決陰莖纖維束。隱匿性陰莖通常伴陰莖發育不良、包皮發育不良。因此，除將陰莖纖維束清除掉后，陰莖增大后，還要再對包皮進行一些處理，將發育不良的包皮進行重建，將束縛陰莖生長的因素清理掉，隱匿性陰莖才能達到較好的手術效果。 其次，手術后陰莖后期會增大，要保證外觀美觀，要保證手術后功能好。因此，隱匿性陰莖手術時間相對比包皮的手術時間長。