隱匿性陰莖外觀比較短小，但在患者陰莖勃起時，陰莖長度正常。通過陰莖的勃起狀態判斷小陰莖和隱匿性陰莖，如果勃起狀態下陰莖非常短小，兒童相對長度小于2.5cm，成人疲軟狀態小于7cm或勃起狀態小于8cm，稱為小陰莖。隱匿性陰莖發病率越來越高。其原因有飲食習慣的調整，兒童肥胖后發病率非常高，另外一個因素是孕產婦富營養化，男性嬰兒出生時非常肥胖，陰莖相對短小。