飛秒激光治療近視眼，通常優于準分子治療近視眼，較以往的準分子激光取得較大進步，并根據手術類型不同，優缺點一般包括以下幾方面：一、飛秒激光手術：1、全飛秒激光手術：不操作角膜瓣，對角膜的神經損傷比較少，術后發生干眼、瓣下渾濁、半復位不良的可能性比較低，術后恢復比較快。但全飛秒手術不容易進行二次手術；2、半飛秒激光手術：通過飛秒激光制作角膜瓣，再輔以準分子激光，較以往的準分子激光相比，瓣膜復位更好，更不易發生瓣下渾濁，術后并發癥的發生幾率較低，導致角膜損傷也較小。半飛秒激光在某種意義上，改善準分子激光治療近視的缺點，優于準分子激光治療近視。二、準分子激光治療近視：在手術時可以對角膜厚度要求更低，適合角膜比較薄的患者進行手術，但是準分子激光手術，一般術后患者有比較明顯的癥狀。