雌激素的對多囊卵巢綜合征的治療不作為常規治療，主要是根據體內雌激素的含量來決定是否補充雌激素。很多多囊卵巢綜合征患者是高雌激素的狀態，肯定不建議使用雌激素補充，但有一些患者可以出現低雌激素的癥狀，可以補充雌激素。需要生育的婦女采用促排卵治療的時候，促排卵藥可以引起雌激素過低、子宮內膜過薄，適當使用雌激素對提高受孕的幾率是有益處。如果體內雌激素水平偏高不建議使用，患者再補充雌激素有可能誘發子宮內膜癌。 PCOS治療要根據患者的臨床表現及是否有生育要求來制定個性化治療方案，雌激素不作為常規治療補充，當患者體內的雌激素水平偏低、子宮內膜偏薄的情況下可以使用雌激素，尤其對于有生育要求、用藥物促排卵治療的多囊患者，可以建議使用雌激素補充。補充雌激素還可以抑制體內雄激素水平，對于改善多毛、痤瘡癥狀，還有卵巢增大、多囊的發生是有幫助。體內雌激素偏高的患者不建議使用雌激素，因為雌激素過高還可能誘發子宮內膜癌。