目前中醫治療肺栓塞并沒有固定的方劑，主要是由于肺栓塞的證型比較特殊，需要根據病人具體的栓塞程度進行辨證，常用的藥物，如川芎、當歸尾、紅花、菖蒲、郁金。另外，三七粉、三七花類的活血藥也經常選用。在用藥時需要注意，很多活血藥物一般不進入肺經，所以在肺栓塞時需要使用引經藥物，幫助活血藥物進入到肺經，一般較常使用的藥物包括桔梗、蘇梗。此外，桑白皮也有清肺的作用，同時可以幫助引經入肺。還需要注意，治療肺栓塞時，活血藥物通常在1-2個星期內不能達到較好的效果，需要長時間用藥。并且需要注意，活血藥物會傷胃，所以需要注意保護脾胃，通常用藥時會配成丸藥，減少對脾胃的刺激。