CT檢查和磁共振可以進行全身的檢查，但CT的最大優勢是肺部檢查。因為肺部含氣體，無法進行磁共振檢查，所以只能做CT檢查，CT檢查在發現肺磨玻璃結節、肺小結節方面有獨特優勢。 CT可以做血管造影，因為CT掃描速度較快，如256排、16排、64排，排數越多、掃描時間越短，做血管造影的優勢越強。不論是冠脈還是頸動脈，CT血管造影顯示較清楚，可觀察頸動脈鈣化斑塊、有無狹窄、有無動脈粥樣硬化。因為CT掃描速度較快，故在上述檢查上具有絕對優勢，無法被其它檢查方法替代。