多囊卵巢到目前為止，并不清楚是基因或染色體改變引起，還是其它理化因素，像接觸有毒物質，或其它環境造成，沒有明確原因。多囊卵巢是內分泌失調疾病，部分女性在人生中可能會有多囊卵巢內分泌失調的表現。由于卵巢形成多囊狀，卵巢在卵泡發育過程中出現問題，不能形成優勢卵泡，多個卵泡在發育過程中，沒有受到優勢卵泡抑制，可能共同競爭性發展，可能都會長大，但不能排卵，導致卵巢形成多囊狀。由于多囊狀，卵巢會增大，B超可以看到多囊卵巢，此外分泌激素也會改變。因為沒有排卵，所以沒有孕激素保護，只有雌激素，甚至伴有雄激素增高。沒有排卵也可能會沒有月經來潮，導致月經稀發，也可以不孕，還可以伴有高雄激素血癥和胰島素抵抗。