臨床上胎兒停止發育大部分是胚胎自身因素導致，臨床上導致胚胎停育的原因有以下幾種：1、胚胎自身因素：比如胚胎合并有染色體數目的異常、染色體結構異常，或基因片段發生突變導致的異常。在遺傳物質異常基礎上的胎兒，通常在早孕期間就會在發育過程中發生胚胎停育現象；2、孕婦合并內科疾病：比如合并貧血、甲狀腺功能亢進癥、甲狀腺功能減低，或者嚴重的肝腎疾病等。在孕婦合并內科疾病的情況下，胚胎容易導致流產以及胎兒停止發育；3、孕婦接觸有毒物質：孕婦接觸有毒的藥物、毒物或者放射線等，會使早期胎兒停止發育。綜上所述，胚胎停止發育的原因主要是胎兒的自身因素，還有孕婦的身體狀況，以及是否接觸外界的毒物綜合導致。