甲硝唑可以治療幽門螺桿菌感染，但由于幽門螺桿菌對于甲硝唑的耐藥率普遍較高，所以目前并不作為首選推薦藥物。幽門螺桿菌屬于與消化系統疾病密切相關的一種細菌，可以引起慢性胃炎、消化性潰瘍，甚至與消化道腫瘤也有一定關系。目前常用抗生素治療幽門螺桿菌感染，包括阿莫西林、克拉霉素、左氧氟沙星、呋喃唑酮、替硝唑、甲硝唑等。而在治療幽門螺桿菌感染時，對于抗生素需根據是否過敏以及當地幽門螺桿菌的耐藥情況為患者進行個體化選擇。如果當地幽門螺桿菌對于甲硝唑的耐藥率較低，仍然可以選擇此類藥物。但部分患者在應用此類藥物治療幽門螺桿菌感染時，可能會出現惡心等不適癥狀，屬于常見的反應。