慢性阻塞性疾病的病變主要是在氣道、肺實質和肺血管的部位，氣道是中央氣道和周圍氣道，包括了比較大的氣道和小氣道，部位都可以有病變，主要可以造成通氣功能和換氣功能的障礙，引起咳嗽、咳痰、呼吸困難等癥狀。發生嚴重的阻塞性通氣功能障礙時，會導致阻塞性通氣功能障礙，嚴重者則可以導致低氧或者是二氧化碳儲留。因為通氣和換氣功能無法實現，體內就會缺氧，而肺主要是實現通氣、換氣的功能，當肺部組織發生病變時，就會導致身體的低氧和二氧化碳潴留發生。如果氧分壓＜50mmHg，二氧化碳分壓＞50mmHg，此時就可以診斷呼吸功能衰竭，這就是對呼吸系統最大的危害。出現慢阻肺的同時，還可以造成肺心病，影響心功能，造成心功能不全、心衰。還可以造成二氧化碳儲留、缺氧，還可以導致肺性腦病等一系列的后果。所以要盡早進行預防，提倡戒煙，使疾病不要發展到晚期的階段或者延緩發展到晚期的階段。