藿香正氣丸可以治療腹瀉，一般來說治療暑濕泄瀉、或者濕熱泄瀉的療效比較好。一般是在夏天感受暑濕或者濕熱，出現脘腹脹滿、脘腹疼痛、噯氣、惡心、嘔吐，甚至大便稀溏等癥狀時服用。感受暑濕或者濕熱以后，會引起氣機阻滯、氣機不暢，出現舌淡紅、苔白膩、脈濡或者脈滑等癥狀，一般是濕邪過重，或者暑濕過重時才會出現消化不良、大便稀溏的表現，所以可以用藿香正氣丸進行治療。藿香正氣丸除治療感受暑濕的消化不良、腹瀉外，還可以治療一些胃腸型感冒。一般是夏天或者夏秋交接時的胃腸型感冒，出現惡寒、發熱、頭痛、周身疼痛、胃脘部脹滿不適、惡心、嘔吐、大便溏稀，或者大便黏滯不暢等癥狀時，服用藿香正氣丸有一定療效。